VascularDB 是一个免费、全面、用户友好的交互式网络平台，旨在通过整合血管疾病测序数据，为用户提供一键式的预测服务，帮助用户识别关键分子的作用。我们的平台不仅简化了复杂的数据分析流程，还能有效指导实验室中的湿实验操作，显著提高血管疾病研究效率与准确性。
Jun Li1
1.1. Department of Vascular Surgery, First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei, China
Citation:文章正在撰写中
Introduction
VascularDB 是一个全面、用户友好的交互式网络平台，专为血管疾病研究设计。该平台通过整合丰富的 RNA 测序数据，为用户提供免费且一键式的分析工具，帮助用户快速准确地识别关键分子的作用。VascularDB 不仅简化了复杂的数据分析流程，还能有效指导实验室中的湿实验操作，显著提高研究效率与准确性。
数据库内置大量已处理的数据，支持多种血管疾病的分析，包括但不限于主动脉夹层、动脉粥样硬化等。同时，平台集成了多种生物信息学工具，如基因表达谱分析、差异表达基因鉴定、GO 富集分析和 KEGG 通路分析。这些工具帮助用户深入理解基因和通路在疾病发生发展中的作用。VascularDB 提供丰富的可视化图表，如热图、火山图、散点图等，帮助用户直观地展示和解释分析结果。用户无需具备代码基础，只需通过简单的点击操作，即可完成一键式数据分析。
总之，VascularDB 界面简洁直观，操作简便，适合各层次用户。平台整合了大量高质量的 RNA 测序数据和文献资料，确保分析的全面性和准确性。所有功能均免费提供，致力于推动血管疾病研究的发展。科研人员可以利用 VascularDB 快速分析 RNA 测序数据，识别关键基因和通路，更好地理解患者的基因表达特征，加速科研进展，辅助诊断和治疗决策。学生和教育工作者可以将 VascularDB 作为教学工具，帮助学生掌握生物信息学分析的基本方法和技术。
Statistics
Contact
Help
Acknowledgements
Thanks
Author contributions
Funding information
VascularDB数据库的建设资金由Sparkle数据库捐赠。
Competing Interests
We have declared that no competing interest exists.
References
[1] Feng C, Song C, Song S, Zhang G, Yin M, Zhang Y, Qian F, Wang Q, Guo M, Li C. KnockTF 2.0: a
comprehensive gene expression profile database with knockdown/knockout of transcription
(co-)factors in multiple species. Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D183-D193. doi:
10.1093/nar/gkad1016. PMID: 37956336; PMCID: PMC10767813.
[2] Corces MR, Granja JM, Shams S, Louie BH, Seoane JA, Zhou W, Silva TC, Groeneveld C, Wong CK,
Cho SW, Satpathy AT, Mumbach MR, Hoadley KA, Robertson AG, Sheffield NC, Felau I, Castro MAA,
Berman BP, Staudt LM, Zenklusen JC, Laird PW, Curtis C; Cancer Genome Atlas Analysis Network;
Greenleaf WJ, Chang HY. The chromatin accessibility landscape of primary human cancers. Science.
2018 Oct 26;362(6413):eaav1898. doi: 10.1126/science.aav1898. PMID: 30361341; PMCID:
PMC6408149.
[3] L'Yi S, Keller MS, Dandawate A, Taing L, Chen CH, Brown M, Meyer CA, Gehlenborg N. Cistrome
Explorer: an interactive visual analysis tool for large-scale epigenomic data. Bioinformatics.
2023 Feb 3;39(2):btad018. doi: 10.1093/bioinformatics/btad018. PMID: 36688700; PMCID:
PMC9900209.
[4] Keenan AB, Torre D, Lachmann A, Leong AK, Wojciechowicz ML, Utti V, Jagodnik KM, Kropiwnicki
E, Wang Z, Ma'ayan A. ChEA3: transcription factor enrichment analysis by orthogonal omics
integration. Nucleic Acids Res. 2019 Jul 2;47(W1):W212-W224. doi: 10.1093/nar/gkz446. PMID:
31114921; PMCID: PMC6602523.
Start preparation time 2024-11-01
Pilot run time 2024-11-20
Formal running time 2024-12-01